AT3G02620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Plant stearoyl-acyl-carrier-protein desaturase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Plant stearoyl-acyl-carrier-protein desaturase family protein; FUNCTIONS IN: acyl-[acyl-carrier-protein] desaturase activity, oxidoreductase activity, transition metal ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, fatty acid metabolic process, fatty acid biosynthetic process; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribonucleotide reductase-related (InterPro:IPR012348), Fatty acid desaturase, type 2 (InterPro:IPR005067), Ferritin/ribonucleotide reductase-like (InterPro:IPR009078); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Plant stearoyl-acyl-carrier-protein desaturase family protein (TAIR:AT3G02610.1); Has 952 Blast hits to 944 proteins in 218 species: Archae - 0; Bacteria - 446; Metazoa - 2; Fungi - 0; Plants - 447; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 57 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:560256..561760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46158.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 403 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALLLNSTMT VAMKQNPATA VSFMQTTCLG SSFSPPRHLQ VSCVATNPSK TFRPIKEVSN QVTHTITQEK LEIFKSMENW AQENLLSYLK PVETSWQPQD 101: FLPETKDEDR FYEQVKELRD RTKEIPDDYF VVLVGDMITE EALPTYQTVM NTLDGAKDET GVSLTPWAVW LRAWTAEENR HGDLLNKYLY LSGRVDTRHV 201: EKTIQYLIGS GMDTKYENNP YNGYIYTSFQ ERATFISHAN TAKLATTYGD TTLAKICGTI AADEKRHEMA YTRIVEKLFE IDPDGTVQAL ASMMRKRITM 301: PAQLMHDGRD DNLFDHYAAV AQRIGVYTAT DYAGILEFLL RRWEVEKLGM GLSGEGRRAQ DYLCTLPQRI RRLEERADDR VKRASKSKPS VSFSWIYGRE 401: VEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)