AT3G01500.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : carbonic anhydrase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a putative beta-carbonic anhydrase betaCA1. Together with betaCA4 (At1g70410) regulates CO2-controlled stomatal movements in guard cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
carbonic anhydrase 1 (CA1); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: in 8 components; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, prokaryotic-like, conserved site (InterPro:IPR015892), Carbonic anhydrase (InterPro:IPR001765); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: carbonic anhydrase 2 (TAIR:AT5G14740.1); Has 5061 Blast hits to 5044 proteins in 1509 species: Archae - 36; Bacteria - 3893; Metazoa - 59; Fungi - 207; Plants - 363; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 503 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:194853..197873 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37451.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 347 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTAPLSGFF LTSLSPSQSS LQKLSLRTSS TVACLPPASS SSSSSSSSSS RSVPTLIRNE PVFAAPAPII APYWSEEMGT EAYDEAIEAL KKLLIEKEEL 101: KTVAAAKVEQ ITAALQTGTS SDKKAFDPVE TIKQGFIKFK KEKYETNPAL YGELAKGQSP KYMVFACSDS RVCPSHVLDF QPGDAFVVRN IANMVPPFDK 201: VKYGGVGAAI EYAVLHLKVE NIVVIGHSAC GGIKGLMSFP LDGNNSTDFI EDWVKICLPA KSKVISELGD SAFEDQCGRC EREAVNVSLA NLLTYPFVRE 301: GLVKGTLALK GGYYDFVKGA FELWGLEFGL SETSSVKDVA TILHWKL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)