AT2G45760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.343 golgi 0.289 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : BON association protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a protein that is similar to BONZAI1-binding protein BAP1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BON association protein 2 (BAP2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: C2 calcium/lipid-binding domain, CaLB (InterPro:IPR008973), C2 calcium-dependent membrane targeting (InterPro:IPR000008); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: BON association protein 1 (TAIR:AT3G61190.2); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18847125..18847748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22994.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 207 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSYSTFKRSL EIEVISAEGL KVDRKPLKKK TYSVVRIDEK SWASKVDELG GSYPIWKDRF DMEMPINASV RFISIEVYYR TSGSGRDKNV GYAKIPVTDF 101: MGGFAPQGHL NFLSYRLRDE YGDKCGIVNV SIMVKPDGND HKSSLPSSSF AVAPVDYAAC SWQATAAARN NQMWRPRTSS SMVSTAGYGG GRVVTGVPVW 201: CAYQRPS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)