AT2G45310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-D-glucuronate 4-epimerase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
UDP-D-glucuronate 4-epimerase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UDP-D-glucuronate 4-epimerase 4 (GAE4); FUNCTIONS IN: coenzyme binding, racemase and epimerase activity, acting on carbohydrates and derivatives, binding, catalytic activity; INVOLVED IN: cellular metabolic process, carbohydrate metabolic process, nucleotide-sugar metabolic process, metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NAD-dependent epimerase/dehydratase (InterPro:IPR001509), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Nucleotide sugar epimerase (InterPro:IPR008089); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-D-glucuronate 4-epimerase 3 (TAIR:AT4G00110.1); Has 44632 Blast hits to 44622 proteins in 2990 species: Archae - 813; Bacteria - 26318; Metazoa - 807; Fungi - 418; Plants - 1224; Viruses - 43; Other Eukaryotes - 15009 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18682652..18683965 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48538.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 437 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSRLDDIPSS PGKFKMEKSS YLHRLRFQSS LTKFAFFSFF LLCLISLLFL RSPPSINPSS PSDPSRRSLR TNTYGGPAWE KRLRSSARIR TSTNNGITVL 101: VTGAAGFVGT HVSAALKRRG DGVIGLDNFN DYYDPSLKRA RRALLERSGI FIVEGDINDV ELLRKLFKIV SFTHVMHLAA QAGVRYAMEN PSSYVHSNIA 201: GFVNLLEICK SVNPQPAIVW ASSSSVYGLN TKVPFSEKDK TDQPASLYAA TKKAGEEIAH TYNHIYGLSL TGLRFFTVYG PWGRPDMAYF FFTKDILKGK 301: SISIFESANH GTVARDFTYI DDIVKGCLAA LDTAEKSTGS GGKKRGPAQL RVFNLGNTSP VPVSDLVRIL ERQLKVKAKK NLIKMPRNGD VPFTHANISL 401: AQRELGYKPT TDLQTGLKKF VRWYLSYYSG DKKAAAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)