AT2G44810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Mutant has defects in anther dehiscence, pollen maturation, and flower opening. The DAD1 protein is a chloroplastic phospholipase A1 that catalyzes the initial step of jasmonic acid biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DEFECTIVE ANTHER DEHISCENCE 1 (DAD1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, class 3 (InterPro:IPR002921); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT4G16820.1); Has 1715 Blast hits to 1709 proteins in 324 species: Archae - 0; Bacteria - 331; Metazoa - 67; Fungi - 376; Plants - 633; Viruses - 9; Other Eukaryotes - 299 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18479095..18480168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40059.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 357 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEYQGLQNWD GLLDPLDDNL RREILRYGQF VESAYQAFDF DPSSPTYGTC RFPRSTLLER SGLPNSGYRL TKNLRATSGI NLPRWIEKAP SWMATQSSWI 101: GYVAVCQDKE EISRLGRRDV VISFRGTATC LEWLENLRAT LTHLPNGPTG ANLNGSNSGP MVESGFLSLY TSGVHSLRDM VREEIARLLQ SYGDEPLSVT 201: ITGHSLGAAI ATLAAYDIKT TFKRAPMVTV ISFGGPRVGN RCFRKLLEKQ GTKVLRIVNS DDVITKVPGV VLENREQDNV KMTASIMPSW IQRRVEETPW 301: VYAEIGKELR LSSRDSPHLS SINVATCHEL KTYLHLVDGF VSSTCPFRET ARRVLHR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)