AT2G44530.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphoribosyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Phosphoribosyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: magnesium ion binding, ribose phosphate diphosphokinase activity; INVOLVED IN: cellular biosynthetic process, nucleotide biosynthetic process, nucleoside metabolic process, ribonucleoside monophosphate biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoribosyltransferase (InterPro:IPR000836), Phosphoribosyl pyrophosphokinase (InterPro:IPR005946), Phosphoribosyl pyrophosphate synthetase, conserved site (InterPro:IPR000842); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP) synthase 2 (TAIR:AT1G32380.1); Has 11359 Blast hits to 11120 proteins in 2784 species: Archae - 259; Bacteria - 6102; Metazoa - 636; Fungi - 683; Plants - 217; Viruses - 13; Other Eukaryotes - 3449 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18383732..18385974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42499.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 393 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASIVQPSPT FPALNLRRSS LIRPPSSVRF PLCNAADPYK FDGGNSAGFH LLTGDTVPAS FSRTRLEDSI YQNTTRLRIF SGTANPILAQ EISCYLGLDL 101: GKIKIKRFAD GEIYVQLQES VRGCDVFLVQ PTCPPANENL MELLVMIDAC RRASAKTITA VIPYFGYARA DRKTQGRESI AAKLVANLIT QSGADRVLAC 201: DLHSGQSMGY FDIPVDHVYG QPVILDYLAS KAISSEDLVV VSPDVGGVAR ARAFAKKLSD APLAIVDKRR HGHNVAEVMN LIGDVKGKVA IMVDDMIDTA 301: GTISKGAALL HQEGAREVYA CTTHAVFSPP AISRLSSGLF QEVIITNTIP LSEKNYFPQL TVLSVANLLG ETIWRVHDDC SGAIEPFSTL GID |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)