AT2G42070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nudix hydrolase homolog 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nudix hydrolase homolog 23 (NUDX23); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NUDIX hydrolase domain-like (InterPro:IPR015797), NUDIX hydrolase (InterPro:IPR020476), NUDIX hydrolase, conserved site (InterPro:IPR020084), NUDIX hydrolase domain (InterPro:IPR000086); Has 7171 Blast hits to 7171 proteins in 1678 species: Archae - 149; Bacteria - 5807; Metazoa - 107; Fungi - 42; Plants - 74; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 991 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:17549669..17551066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30795.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 280 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLKAVQILGW SSGLTISQRL TKTRKSSTVS FISSSLNLSS VTSSSPRRIF SFKPTRMSSS LPGSDPVANS PTFVSVQSAG DVRKIKFCQW CGGPTKHEIP 101: DGEEKLRAIC THCGKIAYQN PKMVVGCLIE HEGKVLLCKR NIQPSHGLWT LPAGYLEVGE SAAQGAMRET WEEAGATVEV ISPFAQLDIP LIGQTYVIFL 201: AKLKNLHFAP GPESLECRLF ALDEIPFDSL AFSSIYVTLN LYLEDLKKGK LKFHYGTINK RPGSSPSDIR AFSLDYHLQP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)