AT2G41880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : guanylate kinase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Guanylate kinase. Involved in nucleotide metabolism. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
guanylate kinase 1 (GK-1); FUNCTIONS IN: guanylate kinase activity; INVOLVED IN: nucleotide metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Guanylate kinase (InterPro:IPR008144), Guanylate kinase/L-type calcium channel (InterPro:IPR008145), Guanylate kinase, sub-group (InterPro:IPR017665); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: guanylate kinase (TAIR:AT3G57550.1); Has 9957 Blast hits to 9932 proteins in 2781 species: Archae - 0; Bacteria - 5508; Metazoa - 1607; Fungi - 176; Plants - 140; Viruses - 105; Other Eukaryotes - 2421 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:17475088..17477076 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42670.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 387 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGEAPAVLVD HPENGHSNGV CVKSEPENTE ITVDVGDRIF LIGGTHERNN FSIGVQIYDK ISNNWFSPIV LGTGPKPSKG YSAFVLEQGR ILVIKKGSPR 101: NDSIWFLEVD SPYVREQKKL LRKEVVAWSK GVRGNAEKPI VISGPSGVGK GTLISMLMKE FPSMFGFSVS HTTRSPRSME MDGVHYHFAD KKVMEKEIKD 201: GKFLEFASVH GNLYGTSIES VEAVTDSGKR CILDIDVQGA RSVRASSLDA IFIFVCPPSM KELEDRLRAR GTETEEQIQK RLRNAEAEIK EGISSGIFGL 301: ILYNDNLEEC YKKLKNLLGL DGLAHVNGVE IEGINLPIEY AVSKMEDKII IQETGKETRN KIVVDISSLN GGAPGRTRGI LVDAIKF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)