AT2G41860.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Calcium Dependent Protein Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 14 (CPK14); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 9 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, C globular stage, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 32 (TAIR:AT3G57530.1); Has 122682 Blast hits to 119390 proteins in 3750 species: Archae - 178; Bacteria - 14238; Metazoa - 46512; Fungi - 15723; Plants - 23146; Viruses - 441; Other Eukaryotes - 22444 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:17467646..17469786 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60057.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 530 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNCCGTAGS LIQDKQKKGF KLPNPFSNEY GNHHDGLKLI VLKEPTGHEI KQKYKLGREL GRGEFGVTYL CTEIETGEIF ACKSILKKKL KTSIDIEDVK 101: REVEIMRQMP EHPNIVTLKE TYEDDKAVHL VMELCEGGEL FDRIVARGHY TERAAASVIK TIIEVVQMCH KHGVMHRDLK PENFLFANKK ETASLKAIDF 201: GLSVFFKPGE RFNEIVGSPY YMAPEVLRRS YGQEIDIWSA GVILYILLCG VPPFWAETEH GVAKAILKSV IDFKRDPWPK VSDNAKDLIK KMLHPDPRRR 301: LTAQQVLDHP WIQNGKNASN VSLGETVRAR LKQFSVMNKL KKRALRVIAE HLSVEETSCI KERFQVMDTS NRGKITITEL GIGLQKLGIV VPQDDIQILM 401: DAGDVDKDGY LDVNEFVAIS VHIRKLGNDE HLKKAFTFFD KNKSGYIEIE ELRDALADDV DTTSEEVVEA IILDVDTNKD GKISYDEFAT MMKTGTDWRK 501: ASRQYSRDLF KCLSLKLMQD GSLQSNGDTK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)