AT2G39800.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.831 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : delta1-pyrroline-5-carboxylate synthase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
delta1-pyrroline-5-carboxylate synthase 1 (P5CS1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutamate 5-kinase (InterPro:IPR001057), Glutamate 5-kinase, conserved site (InterPro:IPR019797), Aspartate/glutamate/uridylate kinase (InterPro:IPR001048), Gamma-glutamyl phosphate reductase GPR, conserved site (InterPro:IPR020593), Aldehyde dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR016163), Gamma-glutamyl phosphate reductase GPR (InterPro:IPR000965), Aldehyde/histidinol dehydrogenase (InterPro:IPR016161), Delta l-pyrroline-5-carboxylate synthetase (InterPro:IPR005766), Aldehyde dehydrogenase (InterPro:IPR015590), Glutamate 5-kinase, ProB-related (InterPro:IPR005715); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: delta 1-pyrroline-5-carboxylate synthase 2 (TAIR:AT3G55610.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:16598516..16602939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 77441.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 714 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEELDRSRAF ARDVKRIVVK VGTAVVTGKG GRLALGRLGA LCEQLAELNS DGFEVILVSS GAVGLGRQRL RYRQLVNSSF ADLQKPQTEL DGKACAGVGQ 101: SSLMAYYETM FDQLDVTAAQ LLVNDSSFRD KDFRKQLNET VKSMLDLRVI PIFNENDAIS TRRAPYQDSS GIFWDNDSLA ALLALELKAD LLILLSDVEG 201: LYTGPPSDPN SKLIHTFVKE KHQDEITFGD KSRLGRGGMT AKVKAAVNAA YAGIPVIITS GYSAENIDKV LRGLRVGTLF HQDARLWAPI TDSNARDMAV 301: AARESSRKLQ ALSSEDRKKI LLDIADALEA NVTTIKAENE LDVASAQEAG LEESMVARLV MTPGKISSLA ASVRKLADME DPIGRVLKKT EVADGLVLEK 401: TSSPLGVLLI VFESRPDALV QIASLAIRSG NGLLLKGGKE ARRSNAILHK VITDAIPETV GGKLIGLVTS REEIPDLLKL DDVIDLVIPR GSNKLVTQIK 501: NTTKIPVLDG ICHVYVDKAC DTDMAKRIVS DAKLDYPAAC NAMETLLVHK DLEQNAVLNE LIFALQSNGV TLYGGPRASK ILNIPEARSF NHEYCAKACT 601: VEVVEDVYGA IDHIHRHGSA HTDCIVTEDH EVAELFLRQV DSAAVFHNAS TRFSDGFRFG LGAEVGVSTG RIHARGPVGV EGLLTTRWIM RGKGQVVDGD 701: NGIVYTHQDI PIQA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)