AT2G39750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF248, methyltransferase putative (InterPro:IPR004159); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Putative methyltransferase family protein (TAIR:AT5G06050.1); Has 1633 Blast hits to 1528 proteins in 174 species: Archae - 2; Bacteria - 140; Metazoa - 223; Fungi - 78; Plants - 1007; Viruses - 29; Other Eukaryotes - 154 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:16578986..16582281 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 78373.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 694 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKPLTNGDLF KSPTLIKISA LVFVTVAFFY LGKHWSDDGY QQLVFFSSST SGSSIPEVSV SPNSNRVFNL SAIIPTNHTQ IEIPATIRQQ PPSVVADTEK 101: VKVEANPPPP PPPSPSPPPP PGPVKSFGIV DANGVMSDDF EVGEVESDTV EDWGNQTEIV EAKSDGDSKA RVRIKKFGMC PESMREYIPC LDNTDVIKKL 201: KSTERGERFE RHCPEKGKGL NCLVPPPKGY RQPIPWPKSR DEVWFSNVPH TRLVEDKGGQ NWISRDKNKF KFPGGGTQFI HGADQYLDQM SKMVSDITFG 301: KHIRVAMDVG CGVASFGAYL LSRDVMTMSV APKDVHENQI QFALERGVPA MAAAFATRRL LYPSQAFDLI HCSRCRINWT RDDGILLLEI NRMLRAGGYF 401: AWAAQPVYKH EPALEEQWTE MLNLTISLCW KLVKKEGYVA IWQKPFNNDC YLSREAGTKP PLCDESDDPD NVWYTNLKPC ISRIPEKGYG GNVPLWPARL 501: HTPPDRLQTI KFDSYIARKE LFKAESKYWN EIIGGYVRAL KWKKMKLRNV LDMRAGFGGF AAALNDHKLD CWVLSVVPVS GPNTLPVIYD RGLLGVMHDW 601: CEPFDTYPRT YDFLHASGLF SIERKRCEMS TILLEMDRIL RPGGRAYIRD SIDVMDEIQE ITKAMGWHTS LRDTSEGPHA SYRILTCEKR LLRA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)