AT2G39270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; FUNCTIONS IN: nucleobase, nucleoside, nucleotide kinase activity, nucleotide kinase activity, ATP binding, phosphotransferase activity, phosphate group as acceptor; INVOLVED IN: nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolic process, anaerobic respiration, nucleotide metabolic process; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenylate kinase, subfamily (InterPro:IPR006259), Adenylate kinase (InterPro:IPR000850); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: adenosine kinase (TAIR:AT2G37250.1); Has 14804 Blast hits to 14657 proteins in 5112 species: Archae - 98; Bacteria - 9940; Metazoa - 1188; Fungi - 469; Plants - 459; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2650 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:16399983..16401408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32393.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 295 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVSHRLLRP ATTTIKNTFS SLFIRSLSSS SSGSSLDPKI DLEEAAAQLG KSSSTSTSPY KGRNFHWVFL GCPGVGKGTY ASRLSSLLGV PHIATGDLVR 101: EELSSSGLLS SQLKELVNHG KLVPDEFIIS LLSKRLQAGK DKGESGYILD GFPRTVTQAE ILEGVTNIDL VINLKLREEA LLAKCLGRRI CSECGGNYNV 201: ACIDIKGDDD TPRMYMPPLL PPPNCESKLI SRADDTEEVV KERLRIYNKM TQPVEEFYKK RGKLLEFELP GGIPESWARL LRALHLEDDK QSAIA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)