AT2G39180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CRINKLY4 related 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CRINKLY4 related 2 (CCR2); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, receptor activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: TNFR/CD27/30/40/95 cysteine-rich region (InterPro:IPR001368), Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Regulator of chromosome condensation/beta-lactamase-inhibitor protein II (InterPro:IPR009091), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CRINKLY4 related 1 (TAIR:AT3G09780.1); Has 94842 Blast hits to 93551 proteins in 4006 species: Archae - 70; Bacteria - 8434; Metazoa - 36115; Fungi - 7540; Plants - 29604; Viruses - 210; Other Eukaryotes - 12869 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:16344278..16346608 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85307.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 776 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQPNSHIFVI ITISSLIITV SAYGSTGTIA AAFGENGFFC AIDASGKQEV ICWDRGNTNR SLNRPPGEIS GYSPPMTSLS GGEGFLCAIT SNTSRAFCWN 101: LEDPSENLVP RAFQYNSYLQ IASGNNHVCA ISGLYYSGPD YGPVHCWEYS DNTNFTSGLL WNSSFHNPYI DSLMFRKIVS GDGFSCGVTK DGDLVCWGPK 201: SNLLNFSNNE EFEVLASGRN SVCGVSKDSG QLHCFGDETE FGSLPNRPRF IALSAGANHY CGIREDDHGV ECWGRNLNSS SSSSAPNTSG FVAISSSDST 301: TCGVRELDLV LDCWRVHDSS KADYSPPLEL CSPGMCSPRG NCGDGWFAFN ASILKESELT SLCSFHNLNI CLRCGISCLE GYFPSSTCNP NADRVCTPCS 401: LCQNSSCYGI CKIRATKSKE HEQKEQREVR RLVIIIGCSV LGFLVMLIGL SFIPKMTKGS KRDDEERSKM TCCFCFDKNS VEADPDPVPH QSVLLPTAVS 501: LGETKIFRLS ELKDATHGFK EFNELGRGSF GFVYKAVLSD GIHVAVKRAN AATIIHSNNR GFESELEILC KIRHNNIVNL LGYCSEMGER LLVYEYMPHG 601: TLHDHLHGDL SQLDWSMRLK IMLQAARGLD YLHNEVDPPI IHRDVKTSNI LLDGEMCARI ADFGLVSSNE RDSSNSDREG DVYDFGIVLL EILSGRKAID 701: RESDPAGIAE WAVPLIRKGK AAAIIDRNIC LPRNVEPLLK LAELAELAVR ENSNERPNIR NILCFLDLIV KSGLTF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)