AT2G38460.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.951 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : iron regulated 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes IRON REGULATED1 (IREG1/FPN1), one of the Arabidopsis orthologs (AT2G38460/IREG1/FPN1 and AT5G03570/IREG2/FPN2) the iron efflux transporter ferroportin (FPN) identified in animals. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
iron regulated 1 (IREG1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ferroporti-1 (InterPro:IPR009716), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: iron regulated 2 (TAIR:AT5G03570.2); Has 345 Blast hits to 287 proteins in 82 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 164; Fungi - 61; Plants - 95; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 23 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:16103603..16105930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58207.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 524 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENETELRVV HQEEQQREEG EDESQPQNPP PALRRRFVIY LYVGYFLARW SARTWEFSVA LYMIHLWPNS LLLAAIYGAI ESGSTAIFGP IVGQWVEGMD 101: YVKVLRLWLL FQNLSYTIAG GAVIKLLLVS DLKSRNLPVF AILIVLTNLA GAIGVLSTLA GTILIERDWA VVMSEGHPPA VLTKMNSVIR GIDLSSKLLS 201: PVITGLIISF VSLKASAITF AAWATITAWV EYWLFISVYS GVPAITRSNE RRILRSRTKQ VEGRDAPVSV SIVPGTEEGY TGNPPSRTGI LVILDRMSKS 301: SFVGAWRIYF NQEVVLPGVS LALLFFTVLS FGTLMTATLQ WEGIPTYIIG IGRGISATVG LAATLVYPLM QSRLSTLRTG LWSFWSQWSC LLVCVGSIWV 401: KKDKIASYML MAGVAASRLG LWMFDLAVIQ QMQDLVSESD RCVVGGVQNS LQSALDLMAY LLGIIVSNPK DFWILTLISF STVSLAGMLY TIHLYRIRNH 501: IFHLEKIPLL NKCIFKLLPS RGNV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)