AT2G37210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lysine decarboxylase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein of unknown function. It has been crystallized and shown to be structurally almost identical to the protein encoded by At5g11950. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
lysine decarboxylase family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Conserved hypothetical protein CHP00730 (InterPro:IPR005269); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Putative lysine decarboxylase family protein (TAIR:AT3G53450.1); Has 5502 Blast hits to 5500 proteins in 1566 species: Archae - 27; Bacteria - 3836; Metazoa - 10; Fungi - 132; Plants - 402; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1095 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15624253..15626834 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23559.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 215 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEIKGESMQK SKFRRICVFC GSSQGKKSSY QDAAVDLGNE LVSRNIDLVY GGGSIGLMGL VSQAVHDGGR HVIGIIPKTL MPRELTGETV GEVRAVADMH 101: QRKAEMAKHS DAFIALPGGY GTLEELLEVI TWAQLGIHDK PVGLLNVDGY YNSLLSFIDK AVEEGFISPT AREIIVSAPT AKELVKKLEE YAPCHERVAT 201: KLCWEMERIG YSSEE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)