AT2G37190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L11 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L11 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome, zinc ion binding; INVOLVED IN: response to cold, ribosome biogenesis; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L11, C-terminal domain (InterPro:IPR020783), Ribosomal protein L11, N-terminal domain (InterPro:IPR020784), Ribosomal protein L11, conserved site (InterPro:IPR020785), Ribosomal protein L11 (InterPro:IPR000911); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L11 family protein (TAIR:AT3G53430.1); Has 1580 Blast hits to 1580 proteins in 592 species: Archae - 303; Bacteria - 410; Metazoa - 359; Fungi - 167; Plants - 131; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 210 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15619559..15620059 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17942.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 166 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPPKLDPSQI VDVYVRVTGG EVGAASSLAP KIGPLGLAPK KIGEDIAKET AKEWKGLRVT VKLTVQNRQA KVTVVPSAAA LVIKALKEPE RDRKKVKNIK 101: HNGNISFDDV TEIARIMRPR SIAKELSGTV REILGTCVSV GCTVDGKDPK DIQQEIQDGE VEIPEN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)