AT2G36270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the basic leucine zipper transcription factor family, involved in ABA signalling during seed maturation and germination. The Arabidopsis abscisic acid (ABA)-insensitive abi5 mutants have pleiotropic defects in ABA response, including decreased sensitivity to ABA inhibition of germination and altered expression of some ABA-regulated genes. Comparison of seed and ABA-inducible vegetative gene expression in wild-type and abi5-1 plants indicates that ABI5 regulates a subset of late embryogenesis-abundant genes during both developmental stages. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ABA INSENSITIVE 5 (ABI5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor (InterPro:IPR004827), bZIP transcription factor, bZIP-1 (InterPro:IPR011616); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: abscisic acid responsive element-binding factor 1 (TAIR:AT1G49720.1); Has 3780 Blast hits to 3404 proteins in 335 species: Archae - 4; Bacteria - 363; Metazoa - 820; Fungi - 233; Plants - 1594; Viruses - 12; Other Eukaryotes - 754 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15204980..15206571 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47009.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.84 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 442 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVTRETKLTS EREVESSMAQ ARHNGGGGGE NHPFTSLGRQ SSIYSLTLDE FQHALCENGK NFGSMNMDEF LVSIWNAEEN NNNQQQAAAA AGSHSVPANH 101: NGFNNNNNNG GEGGVGVFSG GSRGNEDANN KRGIANESSL PRQGSLTLPA PLCRKTVDEV WSEIHRGGGS GNGGDSNGRS SSSNGQNNAQ NGGETAARQP 201: TFGEMTLEDF LVKAGVVREH PTNPKPNPNP NQNQNPSSVI PAAAQQQLYG VFQGTGDPSF PGQAMGVGDP SGYAKRTGGG GYQQAPPVQA GVCYGGGVGF 301: GAGGQQMGMV GPLSPVSSDG LGHGQVDNIG GQYGVDMGGL RGRKRVVDGP VEKVVERRQR RMIKNRESAA RSRARKQAYT VELEAELNQL KEENAQLKHA 401: LAELERKRKQ QYFESLKSRA QPKLPKSNGR LRTLMRNPSC PL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)