AT2G36260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Iron-sulphur cluster biosynthesis family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Iron-sulphur cluster biosynthesis family protein; FUNCTIONS IN: iron-sulfur cluster binding, structural molecule activity; INVOLVED IN: iron-sulfur cluster assembly; LOCATED IN: mitochondrion; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FeS cluster biogenesis (InterPro:IPR000361), FeS cluster insertion (InterPro:IPR016092); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Iron-sulphur cluster biosynthesis family protein (TAIR:AT2G16710.1); Has 10042 Blast hits to 10041 proteins in 1822 species: Archae - 43; Bacteria - 5814; Metazoa - 244; Fungi - 187; Plants - 169; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3585 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15202786..15203500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12162.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 109 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRKQVLALSD TAAARIRQLL QHQQKPFLRL AVEAKGCNGL SYVLNYAQEK GKFDEVVEEK GVKILVDPKA VMHVIGTEMD FVDDKLRSEF VFVNPNATKC 101: GCGESFTTT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)