AT2G35990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Putative lysine decarboxylase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Putative lysine decarboxylase family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Conserved hypothetical protein CHP00730 (InterPro:IPR005269); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Putative lysine decarboxylase family protein (TAIR:AT5G06300.1); Has 5018 Blast hits to 5017 proteins in 1508 species: Archae - 25; Bacteria - 3489; Metazoa - 10; Fungi - 132; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 977 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15114070..15116647 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23315.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 213 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEETKSRFRR ICVFCGSSSG NKTTYHDAAL QLAHQLVERN IDLVYGGGSV GLMGLISQAV HDGGRHVLGI IPKSLAPREI TGESIGEVIT VSTMHQRKAE 101: MGRQADAFIA LPGGYGTFEE LLEVITWSQL GIHTKPVGLL NVDGFYDSLL TFIDKAVDEG FVSSTARRII VSAPNAPQLL QLLEEYVPKH DDFVSKMVWD 201: NTTDAFTLEG DSF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)