AT2G35840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.983 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Sucrose-6F-phosphate phosphohydrolase family protein; FUNCTIONS IN: phosphatase activity, magnesium ion binding, sucrose-phosphatase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, sucrose biosynthetic process; LOCATED IN: nucleus, cytoplasm; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sucrose-phosphate synthase (InterPro:IPR006380), Sucrose-6-phosphate phosphohydrolase C-terminal (InterPro:IPR013679), HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB (InterPro:IPR006379), Sucrose phosphatase, plant/cyanobacteria (InterPro:IPR012847), Sucrose-phosphate phosphatase (InterPro:IPR006378); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sucrose-phosphatase 1 (TAIR:AT1G51420.1); Has 1523 Blast hits to 1517 proteins in 541 species: Archae - 0; Bacteria - 1269; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 180; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 74 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:15053952..15055776 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47857.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 422 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MERLTSPPRL MIVSDLDHTM VDHHDPENLS LLRFNSLWEH AYRHDSLLVF STGRSPTLYK ELRKEKPLLT PDITIMSVGT EITYGNSMVP DHGWVEALNN 101: KWDLGIVKQE ASNFPELKLQ AETEQRPHKV SFYVEKSKAQ EVTKELSQRF LKRGLDVKII YSGGMDLDIL PQGAGKGQAL AYLLKKLKTE GKLPVNTLAC 201: GDSGNDAELF SIPDVYGVMV SNAQEELLKW HAENAKDNPK VIHAKERCAG GIIQAIGHFK LGPNLSPRDV SDFLEIKVEN VNPGHEVVKF FLFYERWRRG 301: EVENSEAYTA SLKASVHPGG VFVHPSGTEK SLRDTIDELR KYHGDKQGKK FRVWADQVLA TDTTPGTWIV KLDKWEQDGD ERRCCTTTVK FTSKEGEGLV 401: WEHVQQTWSK ETMVKDDSSW II |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)