AT2G35780.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine carboxypeptidase-like 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
serine carboxypeptidase-like 26 (scpl26); FUNCTIONS IN: serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563), Peptidase S10, serine carboxypeptidase, active site (InterPro:IPR018202); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 27 (TAIR:AT3G07990.1); Has 3733 Blast hits to 3660 proteins in 399 species: Archae - 0; Bacteria - 269; Metazoa - 644; Fungi - 857; Plants - 1549; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 414 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15037733..15040104 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51524.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 452 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARLLLLFFF FLILLHYASC SRHEQEKDRI FHLPGEPNDV SFSHFSGYIT VNESAGRALF YWLTESPPSE NPESKPLVLW LNGGPGCSSV AYGAAEEIGP 101: FRINPDGKTL YHNPYSWNKL ANLLFLESPA GVGFSYSNTT SDLYTAGDQR TAEDAYVFLV KWFERFPQYK HREFYIAGES YAGHYVPQLS QIVYEKRNPA 201: INFKGFIVGN AVIDDYHDYV GLFEYWWAHG LISDLTYHNL RITCEFGSSE HPSSKCTKAM EAADLEQGNI DPYSIYTVTC KKEAAALRSR FSRVRHPWMW 301: RAYDPCTEKY SGMYFNSPEV QKAMHANITG LAYPWKGCSD IVGEKWADSP LSMLPIYKEL IAAGLRIWVF SGDTDSVVPI TGTRYSIRAL KLQPLSKWYP 401: WNDDGQVGGW SQVYKGLTLV TIHGAGHEVP LFRPRRAFLL FQSFLDNKPL PM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)