AT2G35740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.867 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nositol transporter 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nositol transporter 3 (INT3); FUNCTIONS IN: carbohydrate transmembrane transporter activity, sugar:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: pollen tube; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: inositol transporter 4 (TAIR:AT4G16480.1); Has 47745 Blast hits to 37638 proteins in 2394 species: Archae - 613; Bacteria - 23181; Metazoa - 6613; Fungi - 11178; Plants - 4182; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1978 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15024489..15026414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63175.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 580 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVEEASKSEQ INITEVWTTT WETPYIMRLA LSAGIGGLLF GYNTGVIAGA LLYIKEEFGE VDNKTWLQEI IVSMTVAGAI VGAAIGGWYN DKFGRRMSVL 101: IADVLFLLGA LVMVIAHAPW VIILGRLLVG FGVGMASMTS PLYISEMSPA RIRGALVSTN GLLITGGQFL SYLINLAFVH TPGTWRWMLG VSAIPAIIQF 201: CLMLTLPESP RWLYRNDRKA ESRDILERIY PAEMVEAEIA ALKESVRAET ADEDIIGHTF SDKLRGALSN PVVRHGLAAG ITVQVAQQFV GINTVMYYSP 301: TILQFAGYAS NKTAMALALI TSGLNAVGSV VSMMFVDRYG RRKLMIISMF GIITCLVILA AVFNEASNHA PKIDKRDSRN FAKNATCPAF APFTASRSPP 401: SNWNCMKCLQ YDCGFCSNGA QEYAPGACIV QSADMKALCH SKGRTFFKDG CPSKFGYLAI VFLGLYIIVY APGMGTVPWI VNSEIYPLRY RGLAGGIAAV 501: SNWMSNLVVS ETFLTLTNAV GSSGTFLLFA GSSAVGLFFI WLLVPETKGL QFEEVEKLLE GGFRPSLLRP TTKENQVETP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)