AT2G35190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : novel plant snare 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
plant-specific SNARE located in cell plate of dividing cells. cofractionates with the cytokinesis-specific syntaxin, KNOLLE, which is required for the formation of the cell plate. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
novel plant snare 11 (NPSN11); FUNCTIONS IN: protein transporter activity, SNAP receptor activity; INVOLVED IN: cytokinesis; LOCATED IN: plasma membrane, cell plate; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Target SNARE coiled-coil domain (InterPro:IPR000727), Sec20 (InterPro:IPR005606); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: novel plant snare 13 (TAIR:AT3G17440.1); Has 871 Blast hits to 814 proteins in 236 species: Archae - 12; Bacteria - 157; Metazoa - 137; Fungi - 78; Plants - 153; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 334 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:14831087..14832979 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29874.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 265 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDPISAVSEE LAEIEGQIND IFRALSNGFQ KLEKIKDANR QSRQLEELTD KMRDCKSLIK DFDREIKSLE SGNDASTNRM LNDRRQSMVK ELNSYVALKK 101: KYSSNLASNN KRVDLFDGPG EEHMEENVLL ASNMSNQELM DKGNSMMDDT DQAIERGKKI VQETINVGTD TSAALKAQTE QMSRVVNELD SIHFSLKKAS 201: KLVKEIGRQV ATDKCIMAFL FLIVIGVIAI IIVKIVNPNN KDIRDIPGVG LAPPAMNRRL LWNHY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)