AT2G34890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.581 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CTP synthase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CTP synthase family protein; FUNCTIONS IN: CTP synthase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: pyrimidine ribonucleotide metabolic process, pyrimidine nucleotide biosynthetic process; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutamine amidotransferase class-I, C-terminal (InterPro:IPR000991), CTP synthase (InterPro:IPR004468), CTP synthase, N-terminal (InterPro:IPR017456), Glutamine amidotransferase type 1 (InterPro:IPR017926); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CTP synthase family protein (TAIR:AT1G30820.1); Has 10859 Blast hits to 10821 proteins in 2916 species: Archae - 240; Bacteria - 5504; Metazoa - 258; Fungi - 230; Plants - 171; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4456 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14718195..14721271 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 66379.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 597 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKYVLVTGGV VSGLGKGITA SSVGVLLQSC GLRVTCIKID PYLNYDAGTI SPYEHGEVFV LDDGSEVDLD LGNYERFLDT TLTRDNNITY GKIQRYVMEK 101: ERKGDYLGET VQIVPHVTDT IREWVERVAM IPVDGKEGPP DVCIIELGGT IGDNESRPFA DALSQLSYSV GRENFCLIHV TLVPVLSVVG EQKTKPTQHS 201: IKDLRGFGLT PNIIACRSTK ALEENVKAKL SRFCYVPIQN IFSLCDVPNI WHIPLLLKEQ KAHEAISKVL NLSGIAKEPS LEKWASMVEI SDGLNVPVRI 301: AIVGKYTDLS DAYLSVLKAL LHASVAFHKK LEVDMVPSCD LEKTKKQEDS RAYEAAWKLL KDANGVLLPG GFGDRGVEGM ILAAKYAREN NIPFLGICLG 401: MQIAVIEFAR SLLCLPDANS TEFEPETKHP CIIFMPEGSI THMGGTMRLG SRRAYFHDKE SKSARLYGNK EFVDERHRHR YEVNPDMVAS LEQAGLSFAA 501: KDETGERMEI VELPSHPFFI GAQFHPEYKS RPRKVSPLFL GLIAASCGEL DAVLNPVSIH QHNQTMFLEK KQHIGWSKKC FGDKNQQEEI SETSFPM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)