AT2G34740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.908 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein phosphatase 2C family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein phosphatase 2C family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein phosphatase 2C-related (InterPro:IPR001932), Protein phosphatase 2C, N-terminal (InterPro:IPR014045), Protein phosphatase 2C (InterPro:IPR015655); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein phosphatase 2C family protein (TAIR:AT4G28400.1); Has 8758 Blast hits to 8744 proteins in 1312 species: Archae - 18; Bacteria - 2269; Metazoa - 1623; Fungi - 728; Plants - 2750; Viruses - 11; Other Eukaryotes - 1359 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:14658730..14660305 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37882.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 339 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKKTIKNSTH RPEDILVHAI KKRRSASGDV KNAVKLKEGE DYLRVEEEIP HDDNVVVIDD GCDHDHDVDD NDDDEEENGR YCRREFDHGY HLVKGQMGHG 101: MEDFIVADTK TVKGHNLGLY AIFDGHSGSD VADYLQNHLF DNILSQPDFW RNPKKAIKRA YKSTDDYILQ NVVGPRGGST AVTAIVIDGK KIVVANVGDS 201: RAILCRESDV VKQITVDHEP DKERDLVKSK GGFVSQKPGN VPRVDGQLAM TRAFGDGGLK EHISVIPNIE IAEIHDDTKF LILASDGLWK VMSNDEVWDQ 301: IKKRGNAEEA AKMLIDKALA RGSKDDISCV VVSFLQWID |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)