AT2G33210.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heat shock protein 60-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
heat shock protein 60-2 (HSP60-2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Chaperonin Cpn60/TCP-1 (InterPro:IPR002423), Chaperonin Cpn60, conserved site (InterPro:IPR018370), Chaperonin Cpn60 (InterPro:IPR001844); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: heat shock protein 60 (TAIR:AT3G23990.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14075093..14078568 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61481.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 580 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYRLVSNVAS KARIARKCTS QIGSRLNSTR NYAAKDIRFG VEARALMLRG VEDLADAVKV TMGPKGRNVI IEQSWGAPKV TKDGVTVAKS IEFKDRIKNV 101: GASLVKQVAN ATNDVAGDGT TCATVLTRAI FTEGCKSVAA GMNAMDLRRG IKLAVDTVVT NLQSRARMIS TSEEIAQVGT ISANGDREIG ELIAKAMETV 201: GKEGVITIQD GKTLFNELEV VEGMKIDRGY ISPYFITNPK TQKCELEDPL ILIHEKKISN INAMVKVLEL ALKKQRPLLI VAEDVESDAL ATLILNKLRA 301: NIKAPGFGEN RKANLHDLAA LTGAQVITEE LGMNLDNIDL SMFGNCKKVT VSKDDTVVLD GAGDKQAIGE RCEQIRSMVE ASTSDYDKEK LQERLAKLSG 401: GVAVLKIGGA SETEVSEKKD RVTDALNATK AAVEEGIVPG GGVALLYASK ELEKLSTANF DQKIGVQIIQ NALKTPVYTI ASNAGVEGAV VVGKLLEQDN 501: PDLGYDAAKG EYVDMIKAGI IDPLKVIRTA LVDAASVSSL LTTTEAVVTE IPTKEVASPG MGGGGMGGMG GMGGMGGMGF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)