AT2G32770.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 13 (PAP13); FUNCTIONS IN: acid phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, C globular stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Purple acid phosphatase, N-terminal (InterPro:IPR015914), Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Purple acid phosphatase-like, N-terminal (InterPro:IPR008963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 15 (TAIR:AT3G07130.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13895838..13898203 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61545.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 545 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVVKYTMSMS FFVIFASTVT IIVHGFPSTL DGPLNPVTAP LDPNLNPIAF DLPESDPSFV KPISEFLLPE QISVSLSYSF DSVWISWVTG EYQIGEKDSA 101: PLDPNCVQSI VQYREFDVRR TRKQNATGHS IVYNQQYSSE NGFMNYTSGI IHHVQLTGLK PNTLYRYQCG DPSLSAMSKE YYFRTMPKST SENYPHRIVV 201: AGDLGLTYNT STVLGHILSN HPDLVVLLGG FSYADTYLAN KTKLDCSSCH CDQNGTSSDC GSCYSSGETY QPRWDYWGRF MEPLTANVPT MMVAGEHEIE 301: PQTENNLTFA AYSSRFAFPS NESGSFSPLY YSFNAGGAHF IVLNSYTLYD NSSDQYIWLE SDLIKINRSE TPWVVATWSL PWYSTFKGHY REAESMRIHL 401: EDLLYNYRVD IVFNSHVDAY ERSNRVYNYT LDQCGPVYIT TGAGGAGKLE TQHVDDPGNI PDPSQNYSCR SSGLNSTLEP VKDETCPVKQ PEYSAYRESS 501: FGFGILEVKN ETHALWSWNR NQDLYYLAAD VIHIVRQPEM CSVCN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)