AT2G32480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ARABIDOPSIS SERIN PROTEASE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Metalloprotease essential for plastid development. Located in the inner membrane of chloroplasts. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ARABIDOPSIS SERIN PROTEASE (ARASP); FUNCTIONS IN: metalloendopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, chloroplast organization; LOCATED IN: chloroplast, plastid, chloroplast inner membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M50 (InterPro:IPR008915), PDZ/DHR/GLGF (InterPro:IPR001478), Peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase (InterPro:IPR004387); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peptidase M50 family protein (TAIR:AT1G05140.1); Has 10037 Blast hits to 7541 proteins in 2236 species: Archae - 41; Bacteria - 6710; Metazoa - 4; Fungi - 0; Plants - 70; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3212 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13788679..13790022 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48729.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 447 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLLNISSSPI SHRNPHFLSN FNNPISYFPR RSKTHLSKSH FFPKFTPLSN QSLKNRVLFG NKRYPDGERF DFRSRAISGI DLGSFESVLE AIAVLTTIIV 101: VHESGHFLAA SLQGIHVSKF AIGFGPILAK FDYNNVEYSL RAFPLGGFVG FPDNDPDSEI PIDDENLLKN RPTLDRSIVV SAGIIANVIF AYAIIFVQVL 201: SVGLPVQEAF PGVLVPEVKT FSAASRDGLL SGDVILAVDG TELSKTGPDA VSKIVDIVKR NPKSNVVFRI ERGGEDFDIR VTPDKNFDGT GKIGVQLSPN 301: VRITKVRPRN IPETFRFVGR EFMGLSSNVL DGLKQTFFNF SQTASKVAGP VAIIAVGAEV ARSNIDGLYQ FAALLNINLA VINLLPLPAL DGGTLALILL 401: EAVRGGKKLP VEVEQGIMSS GIMLVIFLGL FLIVKDTLSL DFIKEML |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)