AT2G31980.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description (TAIR10) | protein_coding : PHYTOCYSTATIN 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
PHYTOCYSTATIN 2 (CYS2); FUNCTIONS IN: cysteine-type endopeptidase inhibitor activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Proteinase inhibitor I25, cystatin, conserved site (InterPro:IPR018073), Proteinase inhibitor I25, cystatin (InterPro:IPR000010), Proteinase inhibitor I25, cystatin, conserved region (InterPro:IPR020381); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cystatin B (TAIR:AT3G12490.2); Has 619 Blast hits to 613 proteins in 77 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 9; Fungi - 0; Plants - 610; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13609246..13609770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 16090.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 10.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 147 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATMLKVSLV LSLLGFLVIA VVTPSAANPF RKSVVLGGKS GVPNIRTNRE IQQLGRYCVE QFNQQAQNEQ GNIGSIAKTD TAISNPLQFS RVVSAQKQVV 101: AGLKYYLRIE VTQPNGSTRM FDSVVVIQPW LHSKQLLGFT PVVSPVY |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
See Also |
|
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)