AT2G31370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor (InterPro:IPR004827), bZIP transcription factor, bZIP-1 (InterPro:IPR011616); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein (TAIR:AT1G06070.1); Has 55870 Blast hits to 21504 proteins in 1137 species: Archae - 14; Bacteria - 3019; Metazoa - 20926; Fungi - 6116; Plants - 3494; Viruses - 436; Other Eukaryotes - 21865 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13379448..13381072 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44692.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 398 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDKEKSPAPP CGGLPPPSPS GRCSAFSEAG PIGHGSDANR MSHDISRMLD NPPKKIGHRR AHSEILTLPD DLSFDSDLGV VGNAADGASF SDETEEDLLS 101: MYLDMDKFNS SATSSAQVGE PSGTAWKNET MMQTGTGSTS NPQNTVNSLG ERPRIRHQHS QSMDGSMNIN EMLMSGNEDD SAIDAKKSMS ATKLAELALI 201: DPKRAKRIWA NRQSAARSKE RKTRYIFELE RKVQTLQTEA TTLSAQLTLL QRDTNGLTVE NNELKLRLQT MEQQVHLQDE LNEALKEEIQ HLKVLTGQVA 301: PSALNYGSFG SNQQQFYSNN QSMQTILAAK QFQQLQIHSQ KQQQQQQQQQ QQHQQQQQQQ QQYQFQQQQM QQLMQQRLQQ QEQQNGVRLK PSQAQKEN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)