AT2G31250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glutamyl-tRNA reductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
HEMA3; FUNCTIONS IN: glutamyl-tRNA reductase activity, NADP or NADPH binding, binding, shikimate 5-dehydrogenase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: porphyrin biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast, cytoplasm; EXPRESSED IN: flower, pollen tube; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Quinate/shikimate 5-dehydrogenase/glutamyl-tRNA reductase (InterPro:IPR006151), Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase, conserved site (InterPro:IPR018214), Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase, C-terminal (InterPro:IPR015896), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase (InterPro:IPR000343), Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase, N-terminal (InterPro:IPR015895); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glutamyl-tRNA reductase family protein (TAIR:AT1G09940.1); Has 4971 Blast hits to 4969 proteins in 1789 species: Archae - 225; Bacteria - 3606; Metazoa - 2; Fungi - 0; Plants - 223; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 915 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13319702..13321526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58693.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 524 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVSNASVVL SPNLETSSSW YHHNPSSSLD LIRIHTLPMN KMTRRGLIQR VRCETSPSSD SSPLDKLKNS PAIDRYTRER SSIVVIGLSF HTSPLEMRER 101: LAIPEAEWPL AITQLCALNH IEEAAVLSTC NRIEIYVSAL SRYRGVKEVT EWMSKRSGIP VSDICQHRFL LYNKDATQHL FQVSAGLESL VIGENQIQSQ 201: VRKAEQVVKQ EGFGRIISTL FEKANKAGKR VRAQTNIASG AVSVSSAAVE LALTKLPGSV SSAMMLVIGA GEMGKRIIEH LVAKGCTKMV VMNRSEDKVA 301: AIRKEMQSGV EIIYKPLDEI LACAAEANVI FTSTSSETPL FLKEHVEILP PCPADYARLF VDISVPRNVG SCVAELDSAR VYNVDDLKEV VAANKEDRAR 401: KSMEALPIIR EETIEFEGWR DSLQTFPTIR KLRSKTERIR AECVEKLISK HGNGMDKKTR EAVEKQTRII VNNILDYPMK HLRYDGTGSS KLRETLENMQ 501: AVNRIYELDG ELLEEKIREK KDKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)