AT2G31070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : TCP domain protein 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
TCP family protein involved in heterchronic regulation of leaf differentiation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
TCP domain protein 10 (TCP10); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Transcription factor, TCP (InterPro:IPR005333), Transcription factor TCP subgroup (InterPro:IPR017887); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: TCP family transcription factor 4 (TAIR:AT3G15030.3); Has 1897 Blast hits to 1802 proteins in 357 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 259; Fungi - 36; Plants - 1423; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 175 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13220984..13222069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40381.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 361 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLKGYSVGE GGGEIVEVQG GHIIRATGRK DRHSKVFTSK GPRDRRVRLS AHTAIQFYDV QDRLGYDRPS KAVDWLIKKA KTAIDKLELG ETTTTTTRQE 101: PVNTKPESPT LVFQRENNDQ TQFVAANLDP EDAMKTFFPA TTTTNGGGGT NINFQNYPHQ DDNNMVSRTT TPPPNLSQDL GLSLHPFQGN NNTVVVPETN 201: NFTTTHFDTF GRISGWNHHD LTMTSSSSSE HQQQEQEERS NGGFMVNHHP HHHHHQPSMM TLLNSQQQQV FLGGQQQQQQ RGTLQSSLFP HSFRSWDHHQ 301: TTSDHHHHQN QASSMFASSS QYGSHGMMMM QGLSFPNTTR LLHGEEATQP NSSSSPPNSH L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)