AT2G30890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.583 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b561, eukaryote (InterPro:IPR004877), Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane (InterPro:IPR006593); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane protein family (TAIR:AT4G18260.1); Has 487 Blast hits to 487 proteins in 83 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 34; Fungi - 77; Plants - 362; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:13147774..13149663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29064.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 257 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEIHHQLLVS LLFLLLPLCS SQENTRSLAI DVNGPVETSP ISEKLNPKLV YEIKVHGFML WAAMGVLMPI GIISIRLMSI KDQPIITLRR LFFLHVTSQM 101: VAVILVTIGA VMSVINFNNS FSNHHQQLGI GLYVIVWFQA LLGFLRPPRE EKARRKWFVG HWILGTSIAI LGIINIYTGL HAYAKKTSKS ANLWTILFTA 201: QLSCIALVYL FQDKWSYIQS QATFNRNQSV DHNSNISTAE TGHGYEVEES KPELEKC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)