AT2G30240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cation/hydrogen exchanger family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plasma membrane localized potassium transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATCHX13; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cation/H+ exchanger (InterPro:IPR006153); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cation/hydrogen exchanger 14 (TAIR:AT1G06970.1); Has 5085 Blast hits to 5064 proteins in 1363 species: Archae - 243; Bacteria - 3825; Metazoa - 0; Fungi - 120; Plants - 544; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 353 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:12899907..12902779 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 92194.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 831 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELSMFGRED TNSSQWGEVH GPFMLEEIVC QAQNMLTSRG IFMKSNPLKY ALPLLLLQMS VIIVTSRLIF RVLQPLKQGM ISAQVLTGVV LGPSFLGHNV 101: IYMNMFLPAG GKIIIQTLSN VGFVIHLFLL GLKIDGSIIR KAGSKAILIG TASYAFPFSL GNLTIMFISK TMGLPSDVIS CTSSAISLSS MTSFPVTTTV 201: LAELNILNSE LGRLATHCSM VCEVCSWFVA LAFNLYTRDR TMTSLYALSM IIGLLLVIYF VFRPIIVWLT QRKTKSMDKK DVVPFFPVLL LLSIASLSGE 301: AMGVHAAFGA FWLGVSLPDG PPLGTELAAK LEMFASNLFL PCFIAISGLQ TNFFEITESH EHHVVMIEII LLITYGCKFL GTAAASAYCQ TQIGDALCLA 401: FLMCCQGIIE VYTTIVWKDA QVVDTECFNL VIITILFVTG ISRFLVVYLY DPSKRYKSKS KRTILNTRQH NLQLRLLLGL YNVENVPSMV NLLEATYPTR 501: FNPISFFTLH LVELKGRAHA LLTPHHQMNK LDPNTAQSTH IVNAFQRFEQ KYQGALMAQH FTAAAPYSSI NNDICTLALD KKATLIVIPF HKQYAIDGTV 601: GQVNGPIRTI NLNVLDAAPC SVAIFIDRGE TEGRRSVLMT NTWQNVAMLF IGGKDDAEAL ALCMRMAEKP DLNVTMIHFR HKSALQDEDY SDMSEYNLIS 701: DFKSYAANKG KIHYVEEIVR DGVETTQVIS SLGDAYDMVL VGRDHDLESS VLYGLTDWSE CPELGVIGDM LTSPDFHFSV LVVHQQQGDD LLAMDDSYKL 801: PNVEHQKIGD TGIQQRFSAE EGFTTIDLGK R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)