AT2G30020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein phosphatase 2C family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes AP2C1. Belongs to the clade B of the PP2C-superfamily. Acts as a MAPK phosphatase that negatively regulates MPK4 and MPK6. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Protein phosphatase 2C family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein phosphatase 2C, manganese/magnesium aspartate binding site (InterPro:IPR000222), Protein phosphatase 2C-related (InterPro:IPR001932), Protein phosphatase 2C (InterPro:IPR015655), Protein phosphatase 2C, N-terminal (InterPro:IPR014045); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein phosphatase 2C family protein (TAIR:AT1G07160.1); Has 6969 Blast hits to 6779 proteins in 496 species: Archae - 2; Bacteria - 405; Metazoa - 1770; Fungi - 794; Plants - 2680; Viruses - 9; Other Eukaryotes - 1309 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12814437..12815904 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42422.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 396 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSCSVAVCNS PVFSPSSSLF CNKSSILSSP QESLSLTLSH RKPQTSSPSS PSTTVSSPKS PFRLRFQKPP SGFAPGPLSF GSESVSASSP PGGVLKRKRP 101: TRLDIPIGVA GFVAPISSSA AVAATPREEC REVEREGDGY SVYCKRGRRE AMEDRFSAIT NLHGDRKQAI FGVYDGHGGV KAAEFAAKNL DKNIVEEVVG 201: KRDESEIAEA VKHGYLATDA SFLKEEDVKG GSCCVTALVN EGNLVVSNAG DCRAVMSVGG VAKALSSDHR PSRDDERKRI ETTGGYVDTF HGVWRIQGSL 301: AVSRGIGDAQ LKKWVIAEPE TKISRIEHDH EFLILASDGL WDKVSNQEAV DIARPLCLGT EKPLLLAACK KLVDLSASRG SSDDISVMLI PLRQFI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)