AT2G29880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G27260.1); Has 260 Blast hits to 212 proteins in 20 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1; Fungi - 10; Plants - 240; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12742536..12743545 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35623.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 308 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESGDQAGET SKKKKKGPYM SWSDQECYEL TAILVDAIKR GWRDKNGTIS KTTVERKILP LLNKKFKCNK TYTNYLSRMK SMKKEYSVYA ALFWFSSGFG 101: WDPITKQFTA PDDVWAAYLM GHPNHHHMRT STFEDFEDLQ LIFESAIAKG NNAFGLGGDS NAETFEEEDD LQAGDNVNHM EINDDEVNET LPKEKLPTRK 201: RSKTNRNGDR SDSINHGESS EKVLSEMIGV GTNIINLIQQ REERHQREVE FRETEKKKNN VWDAIKEIPD LEDHIRYDAV TKIHTLNLKD VFVSMSVEER 301: LGWIRRNT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)