AT2G27070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : response regulator 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Response Regulator: B- Type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
response regulator 13 (RR13); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Response regulator, plant B-type (InterPro:IPR017053), CheY-like (InterPro:IPR011006), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), Signal transduction response regulator, receiver domain (InterPro:IPR001789), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287), Myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class (InterPro:IPR006447); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: response regulator 21 (TAIR:AT5G07210.1); Has 23369 Blast hits to 23309 proteins in 2411 species: Archae - 233; Bacteria - 19177; Metazoa - 5; Fungi - 117; Plants - 1946; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1891 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11555781..11560215 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65326.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 575 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFAQSVYNQ SSVLKINVMV VDDNRVFLDI WSRMLEKSKY REITVIAVDY PKKALSTLKN QRDNIDLIIT DYYMPGMNGL QLKKQITQEF GNLSVLVMSS 101: DPNKEEESLS CGAMGFIPKP IAPTDLPKIY QFALTYKRNG KSTLSTEQNQ KDANVSVPQQ IMLVPEQAYV LKTKKKNCSS KSDTRTVNST NVSHVSTNGS 201: RKNRKRKPKG GPSDDGESLS QPPKKKKIWW TNPLQDLFLQ AIQHIGYDKV VPKKILAIMN VPYLTRENVA SHLQKYRLFV KRVVHQGRFS MLSDRGKDSM 301: FRQTHIKEPY VNYYTPSTSW YETSLNNRSF YSESVHGHSR LLSEAREPVR YNQMSYNYMN RNISFENQPS QNEETRTVFE PPVMANKISQ TSQVLGFGQL 401: GPSAISGHNF NTNMMSSYGS LTPNQPGTSH FSYGMQSVLN NENATYNPQP PANATTQPNL DELPQLENLN LYNDLGNTSE LPYNISNFQS DDNKKQGEED 501: GDWTFVNINQ DQSNGESSNT IATPETNTPN FNINPNQNQG QAVPEFTDWS FLDQQPRRLG IRIGYFGFKF SGLEV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)