AT2G26820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.893 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phloem protein 2-A3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phloem protein 2-A3 (PP2-A3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: AIG1 (InterPro:IPR006703); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein (TAIR:AT1G33900.1); Has 7075 Blast hits to 5270 proteins in 530 species: Archae - 11; Bacteria - 693; Metazoa - 2878; Fungi - 405; Plants - 651; Viruses - 87; Other Eukaryotes - 2350 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11437808..11442199 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52220.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 463 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSEPIKNIVL VGRTGNGKSS TGNTLLGTKQ FKSKNQAKGV TMICEMYRAA IQDGPIINVI DTPGLCDSFV PGDDISNEII NCLTMAEEGI HAVLLVLSAR 101: GRISKEEEST VNTLQCIFGS QILDYCIVVF TGGDDLEEDD QTLDDYFRAG CPEFLTKVLR LCGGRKVLFD NKSKDEKKKV EQVKQLLARV ENVGEQTGGI 201: PYTYQLHRKI KEENDERLRE EERVIESKNR AEAELAEMQQ NLLMEKEKLQ MEEAKNKQLI AQAEANEKLM EQERAKNRAE TELAAVMVEK LQMEEEKNKQ 301: LIAQANRMIC ARDLNIEWSH SEEHWKWVNL DHNISSNTFV EVAELLGVYW FDVSGSLDTT EMAPWTHYEV LFVVNLKDSA FKWNAAVKMN LFYINSRPGG 401: PGTQERAVDM RQHIGKGWVT IHAGEFITTP ENVGLIGFRM SEVDSGDNRG GLIVKGVLIR PIN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)