AT2G26680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Methyltransferase FkbM (InterPro:IPR006342); Has 1073 Blast hits to 1073 proteins in 243 species: Archae - 45; Bacteria - 509; Metazoa - 0; Fungi - 4; Plants - 60; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 451 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11344003..11345288 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35196.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 319 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASAWKKDKN QKLLSPKTLI SLLVLSIIFL SSLFFFFSNS SLQYSNPNLS INSPYPIPPF DCFKCPQSKP IIANVVENLK YPFVYSLADL GNLPEKPHKN 101: IVRLLKGKPF RKPDISATIQ EVLDSMRASG KNGIVVDVGA NVGMASFAAA VMGFKVLAFE PVFENLQRIC DGIWFNRVAS LVTVFEAAAS DRTGDITFHK 201: LVGRLDNSAV SEVGARLAFK SNKEIAVQVK SIPLDKLIPP SQPVLLIKID VQGWEYHVLK GAKKLLSGKP AEAPYLIYEE DERLLTASNS SSKEIRDFLK 301: SVGYSKCSQH GTDAHCTKE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)