AT2G26430.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arginine-rich cyclin 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an ania-6a type arginine-rich cyclin which confers tolerance to LiCl and NaCl when expressed in yeast. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
arginine-rich cyclin 1 (RCY1); FUNCTIONS IN: cyclin-dependent protein kinase regulator activity; INVOLVED IN: response to salt stress, regulation of cell cycle, regulation of transcription; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin L (InterPro:IPR017060), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Transcription regulator cyclin (InterPro:IPR015429), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin (InterPro:IPR006670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cyclin family protein (TAIR:AT5G45190.1); Has 13929 Blast hits to 7818 proteins in 361 species: Archae - 16; Bacteria - 504; Metazoa - 7801; Fungi - 1963; Plants - 1370; Viruses - 16; Other Eukaryotes - 2259 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11243433..11245255 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41428.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 361 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATGQVLFQR FYCKKSLAKF DVKIVAASCV WLASKLEENP KKARQVIIVF HRMECRRENL PLEHLDMYAK KFSELKVELS RTERHILKEM GFVCHVEHPH 101: KFISNYLATL ETPPELRQEA WNLANDSLRT TLCVRFRSEV VACGVVYAAA RRFQVPLPEN PPWWKAFDAD KSSIDEVCRV LAHLYSLPKA QYISVCKDGK 201: PFTFSSRSGN SQGQSATKDL LPGAGEAVDT KCTAGSANND LKDGMVTTPH EKATDSKKSG TESNSQPIVG DSSYERSKVG DRERESDREK ERGRERDRGR 301: SHRGRDSDRD SDRERDKLKD RSHHRSRDRL KDSGGHSDKS RHHSSRDRDY RDSSKDRRRH H |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)