AT2G26200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Methyltransferase-16, putative (InterPro:IPR019410), Methyltransferase type 12 (InterPro:IPR013217); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Methyltransferase family protein (TAIR:AT1G54650.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11152875..11156330 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63776.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 565 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSGLKIIEE PQKPIEKLQI YPTANAGVSP FWRDKYERDA KKYWDIFYKH HGDRFFKDRH YLDKEWNSYF SVSGKSVILE VGCGAGNTIF PLIATYPDIF 101: VYACDFSPRA VELVKAHDEY TETRVCAFAC DLTGDGLDKH ISPSSVDIVT MIFVLSAVSP EKMSSVLQNI RKVLKPNGCI LFRDYAVGDL AQERFSGKDQ 201: RISENFYVRG DGTRAFYFSN EFLETLFSEQ GFEVEELDVC CKQVENRSRE LVMNRRWVQA TFRRTNGNKN PCDSLTPAKL DKSEQQDSIQ SKSEEQERKE 301: IIDYTDIDIS DGLAMEMFGA SPSSHEMSVV KLRDSAFKIK LLSKEYQHTC KSTGLMLWES ARLMASVLDR NPNIVSGKRV LELGCGCTGI CSMVAARSAN 401: LVVATDADTK ALTLLTENIT MNLQSSLLGK LKTSVLEWGN KEHIESIKRL ACEGFEVIMG TDVTYVAEAI IPLFETAKEL ILRKMGDDLE VQEKPALILC 501: HVFRRVDEPS LLSAASKFGF KLADRWAANS KESPIGNIID SWFSEKDLVA EIPSSALHIL YFQME |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)