AT2G25355.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.981 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PNAS-3 related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
PNAS-3 related; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 14 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PNAS-3 related (TAIR:AT4G32175.1); Has 410 Blast hits to 410 proteins in 205 species: Archae - 27; Bacteria - 0; Metazoa - 113; Fungi - 136; Plants - 59; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 75 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:10801391..10803591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26481.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 241 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGTEVSTSPT SLIDQTVVPG DVVLDLSNMT NQTIKLGSGL RQDNEVISVM RAGKLRYSKP NKYWVESSHK RYVPRPEDHV LGIVVDCKGE NYWIDIKGPQ 101: LALLPVLAFE GANRRNYPKF EVSTLLYTRV VKTNTGMNPE LSCVDESGKA AGFGPLKDGF MFETSTGLSR MLLSSPTCPV LEALGKKLSF ETAFGLNGRC 201: WVHAAAPRIV IIVANALMNS ETLSGTQQRI MVEKLLEKIS D |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)