AT2G24450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : FASCICLIN-like arabinogalactan protein 3 precursor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
FASCICLIN-like arabinogalactan protein 3 precursor (FLA3); FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: anchored to membrane; EXPRESSED IN: 9 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, C globular stage, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAS1 domain (InterPro:IPR000782); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: FASCICLIN-like arabinogalactan protein 5 precursor (TAIR:AT4G31370.1); Has 10338 Blast hits to 6301 proteins in 702 species: Archae - 8; Bacteria - 2389; Metazoa - 2056; Fungi - 1063; Plants - 2613; Viruses - 640; Other Eukaryotes - 1569 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10393019..10393861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29171.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 280 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLKVSSSLL CLTILLAVSS IVSAVNITRV LEKYPEFSTM TELLAKTELT PIINKRQTIT VLALNNDAIG SISGRPEEEV KNILMNHVVL DYFDELKLKA 101: LKEKSTLLTT LYQSTGLGQQ QNGFLNCTKS NGKIYFGSGV KGAPQTAEYI TTVFRNPYNL SVVQISMPIV APGLGSPVKV PPPPPMSSPP APSPKKGAAT 201: PAPAPADEGD YADAPPGLAP ETAPASAPSE SDSPAPAPDK SGKKKMAAAD EAEPPSSASN TGLSFGAVLV LGFVASFVGF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)