AT2G24010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.965 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine carboxypeptidase-like 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
serine carboxypeptidase-like 23 (scpl23); FUNCTIONS IN: serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563), Peptidase S10, serine carboxypeptidase, active site (InterPro:IPR018202); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 22 (TAIR:AT2G24000.1); Has 3412 Blast hits to 3335 proteins in 258 species: Archae - 0; Bacteria - 12; Metazoa - 650; Fungi - 841; Plants - 1598; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 311 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:10214714..10217542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50122.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 440 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIKALPGQPQ VGFSQFSGYV TVNESHGRSL FYWLTESPSS SHTKPLLLWL NGVFKPTKPT LSFILCNRPG CSSIGYGASE EIGPFRINKT GSNLYLNKFT 101: WNTEANILFL ESPAGVGFSY TNTSSDLKDS GDERTAQENL IFLIKWMSRF PQYQYRDFYI VGESYAGHYV PQLAKKIHLY NKAFNNTPII NLKGFMVGNG 201: DMDKHYDRLG AAMYAWSHAM ISDKTYKSIL KHCSFTADKT SDKCNWALYF AYREFGKVNG YSIYSPSCVH QTNQTKFLHG RLLVEEYEYD PCTESYAEIY 301: YNRPDVQRAM HANLTSIPYK WTLCNMVVNN NWKDSEFSML PIYKELTAAG LRIWVFSGDT DAVVPVTGTR LALSKLNLPV KTPWYPWYSE KQVGGWTEVY 401: EGLTFATIRG AGHEVPVLQP ERALTLLRSF LAGKELPRSY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)