AT2G23240.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.634 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Plant EC metallothionein-like protein, family 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Plant EC metallothionein-like protein, family 15; FUNCTIONS IN: zinc ion binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant EC metallothionein-like protein, family 15 (InterPro:IPR000316); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Plant EC metallothionein-like protein, family 15 (TAIR:AT2G42000.2); Has 284 Blast hits to 225 proteins in 80 species: Archae - 0; Bacteria - 6; Metazoa - 54; Fungi - 2; Plants - 164; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 58 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:9895995..9896325 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 8437.78 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.56 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 85 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MADTGKGSAS ASCNDRCGCP SPCPGGESCR CKMMSEASGG DQEHNTCPCG EHCGCNPCNC PKTQTQTSAK GCTCGEGCTC ATCAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)