AT2G22950.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cation transporter/ E1-E2 ATPase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cation transporter/ E1-E2 ATPase family protein; FUNCTIONS IN: calcium-transporting ATPase activity, calmodulin binding; INVOLVED IN: calcium ion transport, cation transport, metabolic process, ATP biosynthetic process; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, male gametophyte, flower, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), ATPase, P-type, calcium-transporting, PMCA-type (InterPro:IPR006408), ATPase, P-type, H+ transporting proton pump (InterPro:IPR000695), ATPase, P-type cation-transporter, N-terminal (InterPro:IPR004014), Haloacid dehalogenase-like hydrolase (InterPro:IPR005834), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303), ATPase, P-type cation-transporter, C-terminal (InterPro:IPR006068); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium ATPase 2 (TAIR:AT4G37640.1); Has 47259 Blast hits to 34730 proteins in 3216 species: Archae - 909; Bacteria - 32565; Metazoa - 4081; Fungi - 2861; Plants - 2101; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 4739 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9766127..9769766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 110779.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 1015 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
0001: MESYLNSNFD VKAKHSSEEV LEKWRNLCSV VKNPKRRFRF TANLSKRYEA AAMRRTNQEK LRIAVLVSKA AFQFISGVSP SDYKVPEEVK AAGFDICADE 0101: LGSIVEGHDV KKLKFHGGVD GLSGKLKACP NAGLSTGEPE QLSKRQELFG INKFAESELR SFWVFVWEAL QDMTLMILGV CAFVSLIVGI ATEGWPQGSH 0201: DGLGIVASIL LVVFVTATSD YRQSLQFRDL DKEKKKITVQ VTRNGFRQKM SIYDLLPGDV VHLAIGDQVP ADGLFLSGFS VVIDESSLTG ESEPVMVTAQ 0301: NPFLLSGTKV QDGSCKMLVT TVGMRTQWGK LMATLSEGGD DETPLQVKLN GVATIIGKIG LSFAIVTFAV LVQGMFMRKL SLGPHWWWSG DDALELLEYF 0401: AIAVTIVVVA VPEGLPLAVT LSLAFAMKKM MNDKALVRHL AACETMGSAT TICSDKTGTL TTNHMTVVKS CICMNVQDVA SKSSSLQSDI PEAALKLLLQ 0501: LIFNNTGGEV VVNERGKTEI LGTPTETAIL ELGLSLGGKF QEERQSNKVI KVEPFNSTKK RMGVVIELPE GGRIRAHTKG ASEIVLAACD KVINSSGEVV 0601: PLDDESIKFL NVTIDEFANE ALRTLCLAYM DIESGFSADE GIPEKGFTCI GIVGIKDPVR PGVRESVELC RRAGIMVRMV TGDNINTAKA IARECGILTD 0701: DGIAIEGPVF REKNQEEMLE LIPKIQVMAR SSPMDKHTLV KQLRTTFDEV VAVTGDGTND APALHEADIG LAMGIAGTEV AKEIADVIIL DDNFSTIVTV 0801: AKWGRSVYIN IQKFVQFQLT VNVVALIVNF SSACLTGSAP LTAVQLLWVN MIMDTLGALA LATEPPNNEL MKRMPVGRRG NFITNAMWRN ILGQAVYQFI 0901: IIWILQAKGK SMFGLVGSDS TLVLNTLIFN CFVFCQVFNE VSSREMEEID VFKGILDNYV FVVVIGATVF FQIIIIEFLG TFASTTPLTI VQWFFSIFVG 1001: FLGMPIAAGL KKIPV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)