AT2G21890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.936 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cinnamyl alcohol dehydrogenase homolog 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cinnamyl alcohol dehydrogenase homolog 3 (CAD3); FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GroES-like (InterPro:IPR011032), Alcohol dehydrogenase GroES-like (InterPro:IPR013154), Alcohol dehydrogenase, zinc-containing, conserved site (InterPro:IPR002328), Alcohol dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR013149), Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing (InterPro:IPR002085); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cinnamyl alcohol dehydrogenase homolog 2 (TAIR:AT2G21730.1); Has 38517 Blast hits to 38503 proteins in 3022 species: Archae - 816; Bacteria - 25778; Metazoa - 1345; Fungi - 2791; Plants - 2951; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 4833 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9331089..9332646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40888.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 375 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVDQNRAFGW AANDESGVLS PFHFSRRENG ENDVTVKILF CGVCHSDLHT IKNHWGFSRY PIIPGHEIVG IATKVGKNVT KFKEGDRVGV GVIIGSCQSC 101: ESCNQDLENY CPKVVFTYNS RSSDGTRNQG GYSDVIVVDH RFVLSIPDGL PSDSGAPLLC AGITVYSPMK YYGMTKESGK RLGVNGLGGL GHIAVKIGKA 201: FGLRVTVISR SSEKEREAID RLGADSFLVT TDSQKMKEAV GTMDFIIDTV SAEHALLPLF SLLKVSGKLV ALGLLEKPLD LPIFPLVLGR KMVGGSQIGG 301: MKETQEMLEF CAKHKIVSDI ELIKMSDINS AMDRLVKSDV RYRFVIDVAN SLLPESSAEI LTEHVDHGVS ITSRF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)