AT2G21045.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.598 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rhodanese-like (InterPro:IPR001763); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfurtransferase 18 (TAIR:AT5G66170.3); Has 3150 Blast hits to 3144 proteins in 1047 species: Archae - 52; Bacteria - 2382; Metazoa - 28; Fungi - 31; Plants - 181; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 476 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9027858..9028805 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19040.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 169 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYTYSLLNLS HCRRQTRKKR KTDHTEGFLM EETKPKTVED VETVDVYTAK GFLSTGHRYL DVRTNEEFAK SHVEEALNIP YMFKTDEGRV INPDFLSQVA 101: SVCKKDEHLI VACNAGGRGS RACVDLLNEG YDHVANMGGG YSAWVDAGFA GDKPPEDLKI ACKFRPKEN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)