AT2G20810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 10 (GAUT10); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: carbohydrate biosynthetic process; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galacturonosyltransferase 11 (TAIR:AT1G18580.1); Has 1414 Blast hits to 1410 proteins in 236 species: Archae - 0; Bacteria - 438; Metazoa - 146; Fungi - 0; Plants - 818; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 12 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8957927..8959610 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61815.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 536 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRRRGGDSFR RAGRRKISNV VWWVLSGIAL LLFFLILSKA GHIEPRPSIP KRRYRNDKFV EGMNMTEEML SPTSVARQVN DQIALAKAFV VIAKESKNLQ 101: FAWDLSAQIR NSQLLLSSAA TRRSPLTVLE SESTIRDMAV LLYQAQQLHY DSATMIMRLK ASIQALEEQM SSVSEKSSKY GQIAAEEVPK SLYCLGVRLT 201: TEWFQNLDLQ RTLKERSRVD SKLTDNSLYH FCVFSDNIIA TSVVVNSTAL NSKAPEKVVF HLVTNEINYA AMKAWFAINM DNLRGVTVEV QKFEDFSWLN 301: ASYVPVLKQL QDSDTQSYYF SGHNDDGRTP IKFRNPKYLS MLNHLRFYIP EVFPALKKVV FLDDDVVVQK DLSSLFSIDL NKNVNGAVET CMETFHRYHK 401: YLNYSHPLIR SHFDPDACGW AFGMNVFDLV EWRKRNVTGI YHYWQEKNVD RTLWKLGTLP PGLLTFYGLT EALEASWHIL GLGYTNVDAR VIEKGAVLHF 501: NGNLKPWLKI GIEKYKPLWE RYVDYTSPFM QQCNFH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)