AT2G20530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : prohibitin 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
prohibitin 6 (PHB6); INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: mitochondrion, plasma membrane, mitochondrial respiratory chain complex I, respiratory chain complex I, membrane; EXPRESSED IN: 11 plant structures; EXPRESSED DURING: M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prohibitin (InterPro:IPR000163), Band 7 protein (InterPro:IPR001107); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: prohibitin 1 (TAIR:AT4G28510.1); Has 3312 Blast hits to 3310 proteins in 1013 species: Archae - 176; Bacteria - 1509; Metazoa - 442; Fungi - 292; Plants - 251; Viruses - 11; Other Eukaryotes - 631 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8842300..8843787 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31638.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 286 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNFKNVKVPK GPGGGVIAAV VIGGLSLYGA THTLYNVDGG HRAIVFNRLV GIKDKVYPEG THLMIPWFER PIIYDVRAKP YLVESTSGSR DLQMVKIGLR 101: VLTRPMADQL PEVYRSLGEN YRERVLPSII HETLKAVVAQ YNASQLITQR ESVSREIRKI LTLRAANFHI ALDDVSITGL TFGKEFTAAI EGKQVAAQEA 201: ERAKFIVEKA EQDKRSAVIR AEGEAKSAQL IGQAIANNQA FLTLRKIEAA REIAQTISRS ANKVYLSSND LLLNLQAMDL DVKPKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)